日前，西南大学农学与生物科技学院研究团队联合中国农业科学院生物技术研究所等单位，发布国内首个油菜全景定量蛋白质组与磷酸化组图谱。该图谱针对油菜萌发、营养生长和生殖生长阶段的24个主要组织取样，以蛋白质组为核心，整合转录组、磷酸化蛋白质组和植物激素数据，构建起覆盖广泛的油菜多组织多组学资源。该研究学术成果已在国际一流期刊《细胞报告（Cell Reports）》在线发表。

西南大学农学与生物科技学院杜海教授介绍，油菜基因组在2022年前完成测序，此后，基因组、重测序和转录组资源快速积累，但对作为生命活动主要执行者的蛋白质组仍缺乏系统性解析。

在杜海看来，通过绘制蛋白质表达图谱，可为基因功能验证和发育动态监测提供直接证据，有效填补基因组信息在功能层面的预测空白。

据悉，西南大学和中国农业科学院生物技术研究所研究团队采用基于Orbitrap Astral质谱平台的窄窗口DIA定量策略，共鉴定28217个蛋白质和13455个磷酸化蛋白质，覆盖71982个磷酸化位点；同时，研究团队在相同组织框架下完成转录组和靶向植物激素检测。

“研究发现，不同发育时期的同一器官在蛋白质组层面总体表现出较高相似性，说明组织身份是驱动油菜多组学差异的重要因素。”杜海对此解释，该油菜全景定量蛋白质组与磷酸化组图谱建立了覆盖油菜主要组织和发育阶段的高质量蛋白质组、磷酸化蛋白质组和植物激素资源，并通过与转录组的联合分析系统揭示了不同层级表达信息之间的互补性，为解析油菜组织功能分化、蛋白质磷酸化调控和激素稳态提供了重要数据基础，也为油菜功能基因组研究和分子育种提供了新的多组学框架与数据支撑。

记者 李志峰 实习生 徐子涵